Они могут быть очень разнообразными, со стороны одного или обоих партнеров.
У женщин они связаны с проблемами овуляции, проходимости маточных труб (предшествующие воспалительные процессы, которые привели к закрытию труб, возникновение эндометриоза с окклюзиями труб, предыдущие операции с развитием спаек и т.д.) или патологиями маточной полости (возникновение аденомиоза, который нарушает имплантацию, полипы, хронический эндометрит, микрополипоз, спайки, частичный или полный синдром Ашермана) или патологиями формы матки (большие миомы или субмукозные миомы, которые деформируют маточную полость и делают ее непригодной для имплантации или вынашивания беременности до конца).
У мужчин это связано с проблемами в производстве сперматозоидов и нарушенными значениями спермограммы, или генетическими дефектами в структуре сперматозоидов, которые не позволяют связываться с яйцеклеткой или активировать ее. Все вышесказанное не может быть так легко установлено, так как для части нарушений еще не существуют тесты. Порой даже лучшие спермограммы имеют дефект одного из белков в своей оболочке и не могут связываться с яйцеклеткой или активировать ее в смысле оплодотворения и деления. Единственный способ это установить — процедура ЭКО, когда мы видим, что при классическом методе ЭКО не произошло оплодотворения, а произошел ТФФ (полная неудача оплодотворения), что дает нам ответ, почему пара не смогла спонтанно достичь беременности и что, скажем, метод ИКСИ является методом оплодотворения для этой пары. Подобных примеров много.
У 15% пар причина бесплодия не может быть выявлена существующими диагностическими методами, и они считаются идиопатическим бесплодием (неизвестной этиологии).